今年，大學新鮮人澤木惣右衛門直保（阪口大助配音）進入農業大學農學部，開始了全新的大學生活。其貌不揚的直保有一個天大的秘密，他能夠看見存在於空氣中的“菌”，甚至能夠徒手抓住菌以及與其對話，這樣的超能力對於農業專業的直保來說，無疑是如虎添翼，但是，麻煩也隨之而來。作為直保的親梅竹馬，直保的秘密無疑為家中經營釀酒行業的結城螢（齋賀觀月配音）創造了不少的便利。同時，外表意外老成的學長美里熏（小西克幸）和各方面都圓滾滾的川濱拓馬（杉山紀彰配音）都對直保產生了濃厚的興趣。在嶄新的校園里，直保和各式各樣的菌在一起的生活就這樣開始了。