吾妻玲二（入野自由配音）本是一介普通的少年，一次偶然中，他被捲入了一起黑社會暗殺事件之中，作為目擊證人，玲二被列入了“消抹名單”之中。組織內部的洗腦專家家塞斯（千葉一伸配音）發現了玲二體內所隱藏的強大力量，如獲至寶的他消除了玲二的記憶，取名Zwei，並致力將他培養成為新一代出色的殺人機器。負責訓練玲二的少女名叫Ein（高桓彩陽配音），她同玲二一樣沒有過去的記憶。盡管Ein表面上冷靜從容，但在內心里，她一直在逃避著同時作為“人”和“機器”這之間無法調節的矛盾。在和玲二相處的日子里，Ein的人性被重新喚醒，她意識到了自己危險的處境，不願意再被人利用的Ein和玲二約定，兩人決心逃出組織的掌控，重新回歸自由的生活。