故事發生在1924年的聖瓦爾貴族子弟寄宿學校瑪格麗特學院，轉學生久城一彌（江口拓也配音）剛剛來到學校，就因外表而被稱為不詳的“黑色死神”。實際上，一彌是個老實又木訥的男孩，可正是這樣的性格使他總是輕易的會被捲入難以用常理來解釋的怪奇事件中。在一次殺人事件中，一彌遇見了身材嬌小一頭金發的少女維多利加（悠木碧配音），這個謎一樣的少女以其高超的智商幫助一彌脫出了險境，兩人的羈絆也從此開始了。在這個校園里，流傳著許許多多聳人聽聞的靈異事件，而在這些事件的背後，作祟的究竟是鬼怪還是人類，這個問題的答案就要交給一彌和維多利加去一一破解了。