突然出現在人類面前的神秘飛翔體“災”。意味著災厄的此一存在憑借異樣的戰鬥力凌駕於所有的航空戰力之上。為對抗他們而開發的，便是對現有機體進行特別調整以實現超水準高機動力，被稱為“子體”的兵器。負責操控的則是名為“阿尼瑪”的操縱機構。它——竟擁有少女的外表。因“災”的緣故而失去駕駛員母親的少年“鳴谷慧”，他遇見了閃耀鮮紅光輝的瑞典制戰鬥機以及駕駛它的阿尼瑪“格里芬”。身為人類最終兵器卻動作不穩定的格里芬，還有一心向往天空的少年，兩人漫長且炙熱的故事就此展開。