位於南洋腹地的一個無名小島,隱藏著一個科技發達的實驗室。實驗室中,一個未知的生命正在孕育。此前不久,瘋狂的科學家們在某個遠古遺跡提取到了最強寶可夢夢幻的基因,隨後利用現代科技,提供基因提升改造,人工創造了無可匹敵的寶可夢——超夢。超夢誕生之初,對自己的命運倍感困惑,旋即暴走。但是一個心懷叵測的男人出現,用花言巧語哄騙了超夢,使其和自己聯手操控世界。然而無論打敗多少對手,超夢仍然充滿困惑,不知自己是誰,為何拼命戰鬥,又為何降生於世。 當他的困擾達到頂點之際,超夢再度暴走,回到了當初誕生的小島,心中充滿了無限的憎恨……