少女戰士法尼婭遇到了名為“導師”的失憶少年，兩人共同展開旅程，逐漸揭開敵人——“異生體”的秘密。與此同時也發現了“某個神秘勢力”隱藏在這之後想要操控少女戰士“斯露德”的人生。她們決定奮起反抗，凈化土地，奪回天空，奪回人類的生存空間。
