戰國時代和幕府時代曾經盛極一時的日本忍者，因為戰敗而強迫解散組織，似乎從歷史中消失。然而事實上，多達20萬人的忍者至今依舊暗中存在，秘密監視著過敏。貌不驚人的雲隱九郎（阪泰鬥配音）每天半死不活待在家里，看起來就是一個純純的廢柴，其實他是一個身懷絕技的忍者。某天，冒充成快遞員的上級找上門來，派他前往某高中與死對頭的忍者部隊作戰。沉寂太久的雲隱總算被組織喚醒了，但是這個任務並不是結束，反而是一系列大事件的開始…… 本片改編自花澤健吾創作的同名漫畫作品。