為了準備學校音樂會的演出，大雄埋頭苦練他並不擅長的豎笛。這時，他的面前出現了一位神秘的外星少女米佳，她格外中意大雄吹出來的跑調的笛聲，於是米佳引領哆啦A夢和夥伴們來到了以音樂為能量的外星球上的一座音樂殿堂。就在這時，一種能夠令音樂從世界上消失的神秘生命體突然降臨，地球陷入危機……！哆啦A夢和夥伴們究竟能否拯救音樂的未來和地球危機呢？