托馬斯（迪倫·歐布萊恩 Dylan O'Brien 飾）、米諾（李基弘 Ki Hong Lee 飾）一行人被帶到一座神秘的庇護所，這個機構由表里不一的詹森（艾丹·吉倫 Aidan Gillen 飾）所管理，詹森為他們提供安穩且舒適的環境，並下令讓幽地鬥士們在醫療實驗室中接受一連串的測試，詹森向托馬斯保證將會把他們送到更加安全的保護區與其他對“閃焰症病毒”免疫的年輕人一同居住。察覺事有蹊蹺的托馬斯決定再次帶領他的夥伴們逃出詹森的掌控，然而等待他們的，卻是比迷宮更加危險的焦土。影片改編自詹姆斯·達什納撰寫的同名反烏托邦科幻小說三部曲的第二部。