何天心容貌清秀可人,個性叛逆,熱心助人,活潑可愛,天不怕地不怕。從父親所留之醫書里學到粗淺的耆黃之術,在民間有『小華陀』之稱號。為學正統宮廷醫術,決心喬裝成男醫士,進宮習醫。好打抱不平的個性讓她結識了假太監張哲三和皇帝朱歷,三人一同經歷了鎮南王叛變和汪公公的迫害,每每都憑自己過人的機智和高超的針灸醫術度過難關。平時與張哲三打打鬧鬧,絲毫不查自己對張哲三的愛意,直到張哲三保護自己而遭砍傷,這才讓天心發現,兩人早在不知不覺間互相愛慕。被知曉女兒身身分後,皇上屢次為自己解危,但心系張哲三的天心,只能將皇上當成好兄弟,因為那獨一無二的愛情,已經給了張哲三。但張哲三卻因陰錯陽差沒當上護衛,而轉為太監,但沒想到執刀從未失手的凈身員劉一刀,當天因為天心配錯了藥,而頭昏眼花,竟然一刀落下刺中張哲三的大腿而非命根子。幸虧劉一刀一時失手,但張哲三從此也成了假太監~小三子。在陪同天心回鄉替窮苦民眾免費診療後,漸對這平時古靈精怪的天心改觀,甚至產生好感,屢次不顧性命也要守護天心。因鎮南王事件戴罪立功,哲三恢復男兒身,成為御前帶刀侍衛,因某次救了游湖溺水的水靈公主,令水靈公主芳心暗許。在得知皇上對天心的愛慕之意,自覺身分配不起天心,便將自身感情隱藏心底,卻不知這樣若即若離的態度,同時牽動著天心和水靈公主。在得知天心為女兒身的身分後,故意加以隱瞞。天心過人的機智和勇氣,不但替皇上攏絡了宮中人心,也使皇上逐漸為她傾心。當皇上發現張哲三對天心有情時,不顧太後反對,執意要立天心為後,而三人之間的關系漸漸起了微妙的變化……另一方面,汪公公發現皇上與因有天心、張哲三相助,在朝中勢力逐漸鞏固,因此便與鎮南王密謀偽造天文凶象,企圖逼皇上退位。羽翼未豐的皇上,能顧全天心、張哲三,並拿回實權嗎?