在火星發現的神秘箱子――“潘多拉魔盒”打開的瞬間,巨大的牆壁突然出現!故事由此開始。被稱為“天空之牆”的牆壁把日本列島分割為三部分,並由此誕生了各自的首都「東都」「西都」「北都」。 其中在“東都”有被稱為Smash的未確認生命體出現並暗中把人類逼入絕境。擋在Smash面前而出現的,是一位青年,其腰上戴著腰帶、 手上握著不可思議的瓶子 。「變身!」―― 青年天才物理學者變身為假面騎士Build,阻擋在Smash的面前!